Muzeum Archeologiczne w Poznaniu ze względu na szeroką zakrojoną działalność naukową, edukacyjna i wystawienniczą, współpracuje z licznymi instytucjami krajowymi i zagranicznymi. Zaprezentowanie pełnej listy muzeów w Polsce, z którymi współdziałamy zajęłoby wiele miejsca. Z tego powodu publikujemy jedynie wybór tych, z którymi łączą nas umowy o stałej współpracy. Nasza instytucja może pochwalić się także bogatym portfolio zagranicznych partnerów – najważniejszych spośród nich wymieniliśmy.